Während der Eiszeit, vor etwa 25.000 Jahren, stieg ein Gletscher ab, der das Valdai-Hochland mit seinen Hügeln schuf. Die entstandenen Gruben begannen sich mit Schmelzwasser zu füllen und der berühmte Seligersee war geboren. Der See hat klares Wasser, was seinem Namen entspricht, der in der Übersetzung aus dem Finnischen „selhea“„sauber, transparent“bedeutet.
Der See überrascht auch mit der Anzahl der darauf befindlichen Inseln, von denen es etwa 169 Stück gibt. Viele von ihnen sind nicht so groß (ca. 10 Meter im Durchmesser), aber die größte ist die Insel Khachin, auf der es 13 eigene kleine Seen gibt.
Eine ebenso erstaunliche wie schöne Legende wurde über den erstaunlichen Seligersee mit seiner Vielfalt an Inseln gebildet. Die Legende erzählt, dass in sehr alten Zeiten die Brüder-Seen Ilmen und Seliger auf der Erde lebten. Die Brüder hatten eine Wolga-Schwester, die sie sehr liebten. Und irgendwie bat die Wolga, ihr das Kaspische Meer zu zeigen, von dessen Größe sie gehört hatte. Die Brüder konnten sie nicht ablehnen und versprachen, den Wunsch zu erfüllen. Sie haben sich auf einer Wanderung zusammengetan, aber vereinbart, alle zusammen und nur tagsüber zu gehen, um sich nicht zu verirren und nicht verloren zu gehen. Und so war es getan, sie gingen mehrere Tage weiter. Aber eines Nachts wachte Ilmens Bruder auf und sah, dass Seligers Bruder ihn betrogen und heimlich mit seiner Schwester gegangen war. Bruder Ilmen ärgerte sich über einen solchen Verrat und verfluchte ihn wegen Betrugs mit folgenden Worten: „O Bruder Seliger, der mich verraten hat, ich verfluche dich für deine Untreue! Also lass es hundert Buckel auf deinem Rücken sein!“Die Götter hörten ihn und dafür, dass Seliger seinen Eid brach, erfüllten sie den Fluch seines Bruders. Seitdem hat Seliger so viele Buckelinseln getragen.
Heute hat der See eine Küstenlinie von 590 Kilometern. Die Wasserfläche beträgt 260 Quadratkilometer. Seliger hat große und kleine Strecken, die durch Meerengen miteinander verbunden sind. Plyos ist ein relativ großes Gewässer zwischen den Inseln.
Der See hat auch Meerengen, die schmalen heißen Zwischenströmungen, die großen heißen Flüsse. Die Gesamtzahl der Verschüttungen beträgt 23. Der See hat einen sandigen Boden. Aufgrund der vielen Untiefen auf dem See können nur kleine Boote darauf fahren, aber es gibt eine große Senke, deren Tiefe 30 Meter beträgt.
Der See selbst und die umliegenden Landschaften sind von bezaubernder Schönheit, so dass dieser Ort einen Besuch wert ist.